Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SNRPD2P62316 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPD2P62316 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPD2P62316 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPD2P62316 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SNRPD2P62316 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPD2P62316 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPD2P62316 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPD2P62316 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPD2P62316 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPD2P62316 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SNRPD2P62316 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPD2P62316 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPD2P62316 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNRPD2P62316 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPD2P62316 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPD2P62316 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNRPD2P62316 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPD2P62316 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNRPD2P62316 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPD2P62316 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPD2P62316 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPD2P62316 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNRPD2P62316 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPD2P62316 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNRPD2P62316 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms