Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPS1P60891 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPS1P60891 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRPS1P60891 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPS1P60891 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPS1P60891 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPS1P60891 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRPS1P60891 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPS1P60891 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPS1P60891 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPS1P60891 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRPS1P60891 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPS1P60891 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPS1P60891 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPS1P60891 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPS1P60891 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PRPS1P60891 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRPS1P60891 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRPS1P60891 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRPS1P60891 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms