Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTBP60709 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTBP60709 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTBP60709 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTBP60709 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTBP60709 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTBP60709 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTBP60709 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTBP60709 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTBP60709 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTBP60709 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTBP60709 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTBP60709 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTBP60709 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTBP60709 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTBP60709 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ACTBP60709 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTBP60709 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTBP60709 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTBP60709 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTBP60709 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTBP60709 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTBP60709 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ACTBP60709 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTBP60709 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTBP60709 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTBP60709 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTBP60709 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTBP60709 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTBP60709 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ACTBP60709 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTBP60709 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTBP60709 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTBP60709 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTBP60709 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTBP60709 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ACTBP60709 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTBP60709 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTBP60709 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTBP60709 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTBP60709 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTBP60709 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ACTBP60709 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTBP60709 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTBP60709 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTBP60709 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTBP60709 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTBP60709 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ACTBP60709 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTBP60709 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTBP60709 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTBP60709 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ACTBP60709 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTBP60709 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTBP60709 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTBP60709 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACTBP60709 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTBP60709 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTBP60709 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTBP60709 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTBP60709 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTBP60709 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACTBP60709 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTBP60709 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTBP60709 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTBP60709 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACTBP60709 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTBP60709 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTBP60709 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTBP60709 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTBP60709 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACTBP60709 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACTBP60709 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTBP60709 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTBP60709 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTBP60709 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTBP60709 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTBP60709 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACTBP60709 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTBP60709 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTBP60709 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTBP60709 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTBP60709 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTBP60709 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTBP60709 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTBP60709 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTBP60709 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACTBP60709 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTBP60709 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTBP60709 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTBP60709 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTBP60709 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTBP60709 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTBP60709 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACTBP60709 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTBP60709 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTBP60709 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTBP60709 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACTBP60709 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACTBP60709 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms