Protein–RNA interactions for Protein: P54840

GYS2, Glycogen [starch] synthase, liver, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYS2P54840 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GYS2P54840 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GYS2P54840 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GYS2P54840 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GYS2P54840 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GYS2P54840 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GYS2P54840 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GYS2P54840 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GYS2P54840 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GYS2P54840 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GYS2P54840 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GYS2P54840 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GYS2P54840 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GYS2P54840 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GYS2P54840 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GYS2P54840 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GYS2P54840 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GYS2P54840 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GYS2P54840 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GYS2P54840 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GYS2P54840 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GYS2P54840 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GYS2P54840 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GYS2P54840 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GYS2P54840 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GYS2P54840 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GYS2P54840 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GYS2P54840 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GYS2P54840 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GYS2P54840 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GYS2P54840 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GYS2P54840 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GYS2P54840 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GYS2P54840 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GYS2P54840 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GYS2P54840 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GYS2P54840 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GYS2P54840 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GYS2P54840 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GYS2P54840 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GYS2P54840 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GYS2P54840 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GYS2P54840 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GYS2P54840 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GYS2P54840 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GYS2P54840 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GYS2P54840 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GYS2P54840 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GYS2P54840 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GYS2P54840 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GYS2P54840 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GYS2P54840 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GYS2P54840 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GYS2P54840 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GYS2P54840 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GYS2P54840 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GYS2P54840 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GYS2P54840 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GYS2P54840 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GYS2P54840 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GYS2P54840 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GYS2P54840 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GYS2P54840 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GYS2P54840 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GYS2P54840 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GYS2P54840 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GYS2P54840 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GYS2P54840 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GYS2P54840 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GYS2P54840 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GYS2P54840 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GYS2P54840 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GYS2P54840 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GYS2P54840 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GYS2P54840 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GYS2P54840 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GYS2P54840 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GYS2P54840 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GYS2P54840 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GYS2P54840 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GYS2P54840 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GYS2P54840 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GYS2P54840 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GYS2P54840 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GYS2P54840 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GYS2P54840 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GYS2P54840 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GYS2P54840 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GYS2P54840 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GYS2P54840 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GYS2P54840 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GYS2P54840 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GYS2P54840 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GYS2P54840 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GYS2P54840 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GYS2P54840 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GYS2P54840 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GYS2P54840 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GYS2P54840 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GYS2P54840 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.7 ms