Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAA2P54646 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAA2P54646 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAA2P54646 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRKAA2P54646 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAA2P54646 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAA2P54646 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAA2P54646 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAA2P54646 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRKAA2P54646 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRKAA2P54646 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAA2P54646 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAA2P54646 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAA2P54646 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAA2P54646 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRKAA2P54646 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAA2P54646 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAA2P54646 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAA2P54646 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAA2P54646 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAA2P54646 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRKAA2P54646 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAA2P54646 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRKAA2P54646 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAA2P54646 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRKAA2P54646 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAA2P54646 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAA2P54646 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRKAA2P54646 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAA2P54646 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAA2P54646 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAA2P54646 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAA2P54646 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRKAA2P54646 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAA2P54646 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAA2P54646 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAA2P54646 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRKAA2P54646 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAA2P54646 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAA2P54646 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAA2P54646 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRKAA2P54646 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRKAA2P54646 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKAA2P54646 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRKAA2P54646 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKAA2P54646 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKAA2P54646 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRKAA2P54646 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAA2P54646 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAA2P54646 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAA2P54646 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAA2P54646 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PRKAA2P54646 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKAA2P54646 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKAA2P54646 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKAA2P54646 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PRKAA2P54646 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAA2P54646 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAA2P54646 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAA2P54646 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PRKAA2P54646 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PRKAA2P54646 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms