Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 COQ8A-205ENST00000478406 3612 ntTSL 211.82□□□□□ -0.527e-8■■■■■ 56
SUB1P53999 UBE2B-206ENST00000507277 644 ntTSL 55.62□□□□□ -1.516e-10■■■■■ 56
SUB1P53999 NUP155-201ENST00000231498 8143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.171e-6■■■■■ 55.9
SUB1P53999 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.566e-11■■■■■ 55.6
SUB1P53999 STAR-202ENST00000520114 3448 ntTSL 28.39□□□□□ -1.076e-11■■■■■ 55.6
SUB1P53999 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.281e-28■■■■■ 55.6
SUB1P53999 TRAPPC4-208ENST00000527680 569 ntTSL 216.47■□□□□ 0.232e-9■■■■■ 55.6
SUB1P53999 TRAPPC4-203ENST00000447216 980 ntTSL 214□□□□□ -0.172e-9■■■■■ 55.6
SUB1P53999 TRAPPC4-205ENST00000525079 768 ntTSL 39.63□□□□□ -0.872e-9■■■■■ 55.6
SUB1P53999 TRAPPC4-209ENST00000528230 583 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.952e-9■■■■■ 55.6
SUB1P53999 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 55.5
SUB1P53999 MRPL15-203ENST00000522521 853 ntTSL 54.62□□□□□ -1.672e-6■■■■■ 55.5
SUB1P53999 ATP6AP2-223ENST00000637165 534 ntTSL 52.25□□□□□ -2.052e-8■■■■■ 55.5
SUB1P53999 DLD-201ENST00000205402 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.955e-8■■■■■ 55.5
SUB1P53999 DLD-203ENST00000417551 2041 ntTSL 53.03□□□□□ -1.925e-8■■■■■ 55.5
SUB1P53999 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.847e-8■■■■■ 55.4
SUB1P53999 MPHOSPH6-202ENST00000563100 723 ntTSL 59.63□□□□□ -0.872e-10■■■■■ 55.1
SUB1P53999 MPHOSPH6-201ENST00000258169 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.152e-10■■■■■ 55.1
SUB1P53999 PHB2-205ENST00000537646 874 ntTSL 511.04□□□□□ -0.649e-19■■■■■ 55
SUB1P53999 SKIV2L2-208ENST00000508716 2185 ntTSL 27.49□□□□□ -1.211e-12■■■■■ 55
SUB1P53999 SKIV2L2-207ENST00000506750 3271 ntTSL 23.44□□□□□ -1.861e-12■■■■■ 55
SUB1P53999 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.526e-11■■■■■ 54.9
SUB1P53999 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.586e-11■■■■■ 54.9
SUB1P53999 HNRNPA2B1-206ENST00000490912 5328 ntTSL 213.3□□□□□ -0.283e-14■■■■■ 54.7
SUB1P53999 HNRNPA2B1-202ENST00000356674 1711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.983e-14■■■■■ 54.7
SUB1P53999 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.432e-7■■■■■ 54.5
SUB1P53999 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.812e-11■■■■■ 54.4
SUB1P53999 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.742e-11■■■■■ 54.4
SUB1P53999 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.582e-11■■■■■ 54.4
SUB1P53999 TSEN34-207ENST00000496583 2372 ntTSL 218.05■□□□□ 0.482e-11■■■■■ 54.4
SUB1P53999 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.132e-11■■■■■ 54.4
SUB1P53999 C6orf48-201ENST00000375633 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.453e-24■■■■■ 54.4
SUB1P53999 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.132e-9■■■■■ 54.4
SUB1P53999 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.312e-9■■■■■ 54.4
SUB1P53999 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.42e-9■■■■■ 54.4
SUB1P53999 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.592e-9■■■■■ 54.4
SUB1P53999 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.72e-9■■■■■ 54.4
SUB1P53999 PPHLN1-205ENST00000395568 2170 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.892e-9■■■■■ 54.4
SUB1P53999 PPHLN1-224ENST00000613154 1863 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.12e-9■■■■■ 54.4
SUB1P53999 PPHLN1-203ENST00000337898 1465 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.152e-9■■■■■ 54.4
SUB1P53999 PPHLN1-202ENST00000317560 1359 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.422e-9■■■■■ 54.4
SUB1P53999 PPHLN1-225ENST00000619544 1449 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.472e-9■■■■■ 54.4
SUB1P53999 PPHLN1-207ENST00000432191 3377 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.552e-9■■■■■ 54.4
SUB1P53999 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -22e-9■■■■■ 54.4
SUB1P53999 GFM1-201ENST00000264263 3453 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.922e-7■■■■■ 54.4
SUB1P53999 GFM1-207ENST00000478254 3470 ntTSL 59.19□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 54.4
SUB1P53999 GFM1-210ENST00000486715 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.112e-7■■■■■ 54.4
SUB1P53999 ATP6V1H-218ENST00000524164 1734 ntTSL 512.54□□□□□ -0.44e-15■■■■■ 54.4
SUB1P53999 CYFIP1-207ENST00000617556 5674 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.673e-7■■■■■ 54.4
SUB1P53999 CYFIP1-211ENST00000619348 3471 ntTSL 1 (best)10.81□□□□□ -0.683e-7■■■■■ 54.4
SUB1P53999 CYFIP1-203ENST00000610365 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.13e-7■■■■■ 54.4
SUB1P53999 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.133e-7■■■■■ 54.4
SUB1P53999 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.377e-8■■■■■ 54.4
SUB1P53999 LTA4H-201ENST00000228740 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.057e-8■■■■■ 54.4
SUB1P53999 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.627e-8■■■■■ 54.4
SUB1P53999 LTA4H-210ENST00000553041 6109 ntTSL 24.12□□□□□ -1.757e-8■■■■■ 54.4
SUB1P53999 LTA4H-203ENST00000537111 1881 ntTSL 1 (best)2.35□□□□□ -2.037e-8■■■■■ 54.4
SUB1P53999 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.521e-7■■■■■ 54.3
SUB1P53999 GBE1-201ENST00000429644 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.811e-11■■■■■ 54.3
SUB1P53999 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.828e-10■■■■■ 54.2
SUB1P53999 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.728e-10■■■■■ 54.2
SUB1P53999 TOP2B-202ENST00000413971 2049 ntTSL 53.36□□□□□ -1.878e-10■■■■■ 54.2
SUB1P53999 ATIC-207ENST00000443953 2187 ntTSL 216.23■□□□□ 0.197e-7■■■■■ 54.1
SUB1P53999 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.057e-7■■■■■ 54.1
SUB1P53999 ATIC-201ENST00000236959 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.827e-7■■■■■ 54.1
SUB1P53999 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.549e-8■■■■■ 53.9
SUB1P53999 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.495e-7■■■■■ 53.9
SUB1P53999 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.112e-11■■■■■ 53.8
SUB1P53999 RABGGTB-208ENST00000471759 2137 ntTSL 25.06□□□□□ -1.62e-11■■■■■ 53.8
SUB1P53999 RABGGTB-213ENST00000496055 3863 ntTSL 23.52□□□□□ -1.852e-11■■■■■ 53.8
SUB1P53999 RABGGTB-203ENST00000459697 1177 ntTSL 22.84□□□□□ -1.952e-11■■■■■ 53.8
SUB1P53999 EXOSC7-207ENST00000481405 768 ntTSL 322.54■■□□□ 1.25e-7■■■■■ 53.6
SUB1P53999 EXOSC7-203ENST00000461361 1593 ntTSL 211.24□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 53.6
SUB1P53999 EXOSC7-210ENST00000491476 1395 ntTSL 511.07□□□□□ -0.645e-7■■■■■ 53.6
SUB1P53999 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.995e-7■■■■■ 53.6
SUB1P53999 EXOSC7-205ENST00000468667 831 ntTSL 58.84□□□□□ -0.995e-7■■■■■ 53.6
SUB1P53999 AIFM1-204ENST00000416073 2248 ntTSL 1 (best)12.55□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 53.6
SUB1P53999 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.772e-7■■■■■ 53.6
SUB1P53999 AIFM1-206ENST00000527892 2105 ntTSL 27.83□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 53.6
SUB1P53999 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.171e-7■■■■■ 53.5
SUB1P53999 PARK7-204ENST00000377493 795 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.791e-7■■■■■ 53.5
SUB1P53999 PARK7-209ENST00000493678 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 53.5
SUB1P53999 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.96e-7■■■■■ 53.5
SUB1P53999 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.353e-9■■■■■ 53.3
SUB1P53999 PSMA6-212ENST00000556167 601 ntTSL 212.61□□□□□ -0.393e-9■■■■■ 53.3
SUB1P53999 PSMA6-208ENST00000554843 655 ntTSL 211.57□□□□□ -0.563e-9■■■■■ 53.3
SUB1P53999 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.763e-9■■■■■ 53.3
SUB1P53999 PSMA6-203ENST00000553688 787 ntTSL 56.18□□□□□ -1.423e-9■■■■■ 53.3
SUB1P53999 PSMA6-207ENST00000554620 790 ntTSL 56.18□□□□□ -1.423e-9■■■■■ 53.3
SUB1P53999 HSPA5-201ENST00000324460 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.078e-8■■■■■ 53.2
SUB1P53999 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.492e-12■■■■■ 53.2
SUB1P53999 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.492e-12■■■■■ 53.2
SUB1P53999 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.472e-12■■■■■ 53.2
SUB1P53999 C20orf24-206ENST00000492721 1044 ntTSL 215.79■□□□□ 0.122e-12■■■■■ 53.2
SUB1P53999 C20orf24-204ENST00000483815 1170 ntTSL 1 (best)13.1□□□□□ -0.312e-12■■■■■ 53.2
SUB1P53999 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.452e-12■■■■■ 53.2
SUB1P53999 C20orf24-207ENST00000494506 874 ntTSL 26.49□□□□□ -1.372e-12■■■■■ 53.2
SUB1P53999 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.632e-8■■■■■ 53.2
SUB1P53999 MRPL11-206ENST00000534488 812 ntTSL 214.12□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 53.2
SUB1P53999 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 53.2
Retrieved 100 of 11,644 protein–RNA pairs in 197.3 ms