Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGDP52209 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGDP52209 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGDP52209 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGDP52209 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PGDP52209 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PGDP52209 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PGDP52209 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PGDP52209 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PGDP52209 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PGDP52209 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGDP52209 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PGDP52209 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGDP52209 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGDP52209 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PGDP52209 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGDP52209 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGDP52209 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGDP52209 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGDP52209 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGDP52209 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PGDP52209 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGDP52209 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGDP52209 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PGDP52209 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGDP52209 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGDP52209 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGDP52209 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PGDP52209 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGDP52209 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGDP52209 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGDP52209 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PGDP52209 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGDP52209 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGDP52209 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGDP52209 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGDP52209 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PGDP52209 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGDP52209 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PGDP52209 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PGDP52209 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PGDP52209 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PGDP52209 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PGDP52209 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGDP52209 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGDP52209 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGDP52209 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PGDP52209 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGDP52209 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGDP52209 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PGDP52209 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGDP52209 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PGDP52209 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGDP52209 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGDP52209 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PGDP52209 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGDP52209 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PGDP52209 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PGDP52209 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGDP52209 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGDP52209 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PGDP52209 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGDP52209 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGDP52209 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PGDP52209 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PGDP52209 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PGDP52209 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PGDP52209 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGDP52209 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGDP52209 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PGDP52209 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGDP52209 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGDP52209 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PGDP52209 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PGDP52209 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGDP52209 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGDP52209 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGDP52209 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGDP52209 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PGDP52209 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGDP52209 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PGDP52209 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGDP52209 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGDP52209 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PGDP52209 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PGDP52209 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PGDP52209 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PGDP52209 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PGDP52209 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PGDP52209 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGDP52209 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGDP52209 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGDP52209 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGDP52209 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGDP52209 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PGDP52209 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PGDP52209 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGDP52209 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PGDP52209 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PGDP52209 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms