Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR4P51679 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR4P51679 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR4P51679 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCR4P51679 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCR4P51679 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCR4P51679 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCR4P51679 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCR4P51679 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCR4P51679 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR4P51679 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR4P51679 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR4P51679 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR4P51679 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR4P51679 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR4P51679 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR4P51679 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCR4P51679 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR4P51679 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR4P51679 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR4P51679 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR4P51679 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR4P51679 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR4P51679 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR4P51679 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR4P51679 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR4P51679 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR4P51679 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR4P51679 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR4P51679 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR4P51679 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR4P51679 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR4P51679 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR4P51679 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR4P51679 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR4P51679 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR4P51679 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR4P51679 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR4P51679 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCR4P51679 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR4P51679 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR4P51679 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR4P51679 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR4P51679 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR4P51679 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCR4P51679 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCR4P51679 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR4P51679 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR4P51679 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR4P51679 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCR4P51679 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR4P51679 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR4P51679 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCR4P51679 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR4P51679 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR4P51679 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR4P51679 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR4P51679 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCR4P51679 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR4P51679 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR4P51679 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR4P51679 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR4P51679 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR4P51679 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR4P51679 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR4P51679 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCR4P51679 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR4P51679 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCR4P51679 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR4P51679 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR4P51679 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR4P51679 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR4P51679 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR4P51679 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR4P51679 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR4P51679 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR4P51679 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCR4P51679 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR4P51679 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCR4P51679 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR4P51679 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR4P51679 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR4P51679 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR4P51679 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCR4P51679 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR4P51679 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR4P51679 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR4P51679 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR4P51679 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR4P51679 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR4P51679 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR4P51679 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR4P51679 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR4P51679 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR4P51679 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCR4P51679 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR4P51679 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR4P51679 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR4P51679 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCR4P51679 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 257.3 ms