Protein–RNA interactions for Protein: P50748

KNTC1, Kinetochore-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNTC1P50748 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNTC1P50748 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNTC1P50748 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KNTC1P50748 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KNTC1P50748 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNTC1P50748 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNTC1P50748 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNTC1P50748 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNTC1P50748 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNTC1P50748 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNTC1P50748 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNTC1P50748 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNTC1P50748 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNTC1P50748 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KNTC1P50748 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KNTC1P50748 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KNTC1P50748 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNTC1P50748 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNTC1P50748 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNTC1P50748 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
KNTC1P50748 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KNTC1P50748 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNTC1P50748 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KNTC1P50748 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNTC1P50748 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNTC1P50748 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNTC1P50748 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
KNTC1P50748 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KNTC1P50748 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms