Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT6CP48668 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT6CP48668 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT6CP48668 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT6CP48668 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT6CP48668 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT6CP48668 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT6CP48668 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT6CP48668 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT6CP48668 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT6CP48668 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT6CP48668 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT6CP48668 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT6CP48668 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT6CP48668 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT6CP48668 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT6CP48668 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT6CP48668 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT6CP48668 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT6CP48668 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KRT6CP48668 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms