Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNFP41002 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNFP41002 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNFP41002 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCNFP41002 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNFP41002 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNFP41002 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNFP41002 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNFP41002 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNFP41002 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNFP41002 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNFP41002 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCNFP41002 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNFP41002 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCNFP41002 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNFP41002 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCNFP41002 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNFP41002 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNFP41002 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCNFP41002 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNFP41002 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCNFP41002 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNFP41002 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNFP41002 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCNFP41002 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNFP41002 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCNFP41002 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNFP41002 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNFP41002 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNFP41002 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNFP41002 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNFP41002 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNFP41002 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNFP41002 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCNFP41002 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNFP41002 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNFP41002 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNFP41002 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNFP41002 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNFP41002 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNFP41002 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNFP41002 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCNFP41002 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNFP41002 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNFP41002 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCNFP41002 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNFP41002 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCNFP41002 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNFP41002 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNFP41002 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNFP41002 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCNFP41002 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNFP41002 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNFP41002 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCNFP41002 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNFP41002 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNFP41002 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNFP41002 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCNFP41002 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNFP41002 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNFP41002 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNFP41002 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCNFP41002 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNFP41002 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCNFP41002 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNFP41002 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCNFP41002 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCNFP41002 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNFP41002 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNFP41002 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNFP41002 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNFP41002 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNFP41002 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNFP41002 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNFP41002 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNFP41002 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNFP41002 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCNFP41002 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNFP41002 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNFP41002 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCNFP41002 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNFP41002 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNFP41002 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNFP41002 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNFP41002 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNFP41002 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCNFP41002 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNFP41002 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNFP41002 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCNFP41002 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNFP41002 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNFP41002 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNFP41002 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNFP41002 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNFP41002 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNFP41002 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNFP41002 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCNFP41002 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCNFP41002 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCNFP41002 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms