Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTRLP40313 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTRLP40313 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTRLP40313 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTRLP40313 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTRLP40313 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTRLP40313 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTRLP40313 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTRLP40313 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CTRLP40313 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CTRLP40313 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTRLP40313 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTRLP40313 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CTRLP40313 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTRLP40313 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTRLP40313 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTRLP40313 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTRLP40313 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTRLP40313 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CTRLP40313 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTRLP40313 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CTRLP40313 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTRLP40313 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTRLP40313 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTRLP40313 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTRLP40313 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CTRLP40313 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTRLP40313 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTRLP40313 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CTRLP40313 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTRLP40313 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTRLP40313 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTRLP40313 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTRLP40313 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTRLP40313 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTRLP40313 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTRLP40313 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTRLP40313 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CTRLP40313 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTRLP40313 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CTRLP40313 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTRLP40313 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTRLP40313 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTRLP40313 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTRLP40313 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTRLP40313 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CTRLP40313 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTRLP40313 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTRLP40313 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTRLP40313 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTRLP40313 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CTRLP40313 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTRLP40313 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTRLP40313 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTRLP40313 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTRLP40313 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTRLP40313 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTRLP40313 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTRLP40313 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTRLP40313 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTRLP40313 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTRLP40313 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTRLP40313 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTRLP40313 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTRLP40313 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTRLP40313 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTRLP40313 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTRLP40313 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTRLP40313 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTRLP40313 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTRLP40313 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTRLP40313 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CTRLP40313 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTRLP40313 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTRLP40313 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTRLP40313 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTRLP40313 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTRLP40313 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CTRLP40313 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTRLP40313 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTRLP40313 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTRLP40313 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTRLP40313 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTRLP40313 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTRLP40313 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CTRLP40313 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTRLP40313 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTRLP40313 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTRLP40313 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CTRLP40313 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTRLP40313 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTRLP40313 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTRLP40313 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CTRLP40313 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTRLP40313 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CTRLP40313 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRLP40313 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRLP40313 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRLP40313 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CTRLP40313 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms