Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCND3P30281 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCND3P30281 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCND3P30281 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCND3P30281 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCND3P30281 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCND3P30281 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCND3P30281 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCND3P30281 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCND3P30281 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCND3P30281 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCND3P30281 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCND3P30281 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCND3P30281 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCND3P30281 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCND3P30281 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCND3P30281 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CCND3P30281 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCND3P30281 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCND3P30281 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCND3P30281 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCND3P30281 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCND3P30281 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCND3P30281 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCND3P30281 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCND3P30281 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CCND3P30281 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCND3P30281 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCND3P30281 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCND3P30281 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CCND3P30281 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCND3P30281 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCND3P30281 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CCND3P30281 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCND3P30281 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCND3P30281 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCND3P30281 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCND3P30281 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCND3P30281 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCND3P30281 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCND3P30281 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCND3P30281 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCND3P30281 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCND3P30281 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCND3P30281 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCND3P30281 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCND3P30281 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCND3P30281 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCND3P30281 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCND3P30281 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCND3P30281 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCND3P30281 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCND3P30281 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCND3P30281 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCND3P30281 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCND3P30281 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCND3P30281 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCND3P30281 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCND3P30281 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCND3P30281 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCND3P30281 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCND3P30281 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCND3P30281 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCND3P30281 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCND3P30281 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCND3P30281 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCND3P30281 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCND3P30281 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCND3P30281 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCND3P30281 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCND3P30281 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCND3P30281 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCND3P30281 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCND3P30281 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCND3P30281 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCND3P30281 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCND3P30281 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCND3P30281 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CCND3P30281 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCND3P30281 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CCND3P30281 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCND3P30281 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCND3P30281 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCND3P30281 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCND3P30281 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCND3P30281 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCND3P30281 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCND3P30281 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCND3P30281 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCND3P30281 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCND3P30281 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCND3P30281 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCND3P30281 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCND3P30281 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCND3P30281 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCND3P30281 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCND3P30281 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCND3P30281 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCND3P30281 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCND3P30281 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms