Protein–RNA interactions for Protein: P27695

APEX1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX1P27695 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
APEX1P27695 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
APEX1P27695 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
APEX1P27695 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
APEX1P27695 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APEX1P27695 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APEX1P27695 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APEX1P27695 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APEX1P27695 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APEX1P27695 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APEX1P27695 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APEX1P27695 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APEX1P27695 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APEX1P27695 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APEX1P27695 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APEX1P27695 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APEX1P27695 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APEX1P27695 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APEX1P27695 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APEX1P27695 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APEX1P27695 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APEX1P27695 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APEX1P27695 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APEX1P27695 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APEX1P27695 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APEX1P27695 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APEX1P27695 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APEX1P27695 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APEX1P27695 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APEX1P27695 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APEX1P27695 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APEX1P27695 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APEX1P27695 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APEX1P27695 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APEX1P27695 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APEX1P27695 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APEX1P27695 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APEX1P27695 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APEX1P27695 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APEX1P27695 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APEX1P27695 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APEX1P27695 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APEX1P27695 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APEX1P27695 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
APEX1P27695 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APEX1P27695 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APEX1P27695 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APEX1P27695 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APEX1P27695 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APEX1P27695 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APEX1P27695 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
APEX1P27695 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APEX1P27695 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APEX1P27695 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APEX1P27695 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APEX1P27695 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APEX1P27695 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APEX1P27695 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APEX1P27695 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APEX1P27695 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APEX1P27695 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APEX1P27695 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
APEX1P27695 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APEX1P27695 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APEX1P27695 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APEX1P27695 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APEX1P27695 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APEX1P27695 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APEX1P27695 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APEX1P27695 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APEX1P27695 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APEX1P27695 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APEX1P27695 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APEX1P27695 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APEX1P27695 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APEX1P27695 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APEX1P27695 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APEX1P27695 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APEX1P27695 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APEX1P27695 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APEX1P27695 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APEX1P27695 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APEX1P27695 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APEX1P27695 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APEX1P27695 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APEX1P27695 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APEX1P27695 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APEX1P27695 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APEX1P27695 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APEX1P27695 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APEX1P27695 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APEX1P27695 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APEX1P27695 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APEX1P27695 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APEX1P27695 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX1P27695 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX1P27695 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX1P27695 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX1P27695 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
APEX1P27695 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms