Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSMA4P25789 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMA4P25789 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMA4P25789 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMA4P25789 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMA4P25789 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMA4P25789 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMA4P25789 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMA4P25789 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMA4P25789 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMA4P25789 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMA4P25789 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMA4P25789 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMA4P25789 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMA4P25789 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMA4P25789 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMA4P25789 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMA4P25789 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMA4P25789 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMA4P25789 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMA4P25789 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMA4P25789 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMA4P25789 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMA4P25789 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMA4P25789 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PSMA4P25789 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSMA4P25789 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSMA4P25789 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1458.9 ms