Protein–RNA interactions for Protein: P22460

KCNA5, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA5P22460 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNA5P22460 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KCNA5P22460 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KCNA5P22460 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KCNA5P22460 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KCNA5P22460 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNA5P22460 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNA5P22460 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KCNA5P22460 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNA5P22460 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNA5P22460 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNA5P22460 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNA5P22460 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNA5P22460 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNA5P22460 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNA5P22460 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KCNA5P22460 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNA5P22460 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNA5P22460 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNA5P22460 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNA5P22460 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNA5P22460 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNA5P22460 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNA5P22460 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNA5P22460 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNA5P22460 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNA5P22460 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
KCNA5P22460 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNA5P22460 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNA5P22460 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNA5P22460 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNA5P22460 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNA5P22460 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNA5P22460 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNA5P22460 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNA5P22460 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNA5P22460 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms