Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CXCL3P19876 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CXCL3P19876 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CXCL3P19876 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CXCL3P19876 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL3P19876 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL3P19876 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL3P19876 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL3P19876 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL3P19876 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL3P19876 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL3P19876 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CXCL3P19876 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CXCL3P19876 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms