Protein–RNA interactions for Protein: P19623

SRM, Spermidine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRMP19623 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRMP19623 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SRMP19623 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRMP19623 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRMP19623 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SRMP19623 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRMP19623 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRMP19623 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRMP19623 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRMP19623 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRMP19623 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRMP19623 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRMP19623 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SRMP19623 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRMP19623 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRMP19623 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRMP19623 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRMP19623 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SRMP19623 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SRMP19623 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRMP19623 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRMP19623 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRMP19623 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRMP19623 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SRMP19623 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SRMP19623 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRMP19623 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRMP19623 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRMP19623 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRMP19623 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRMP19623 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRMP19623 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SRMP19623 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRMP19623 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRMP19623 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRMP19623 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRMP19623 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SRMP19623 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRMP19623 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRMP19623 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRMP19623 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SRMP19623 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRMP19623 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRMP19623 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRMP19623 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SRMP19623 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRMP19623 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRMP19623 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRMP19623 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRMP19623 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SRMP19623 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRMP19623 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRMP19623 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRMP19623 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SRMP19623 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRMP19623 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRMP19623 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRMP19623 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SRMP19623 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRMP19623 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRMP19623 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SRMP19623 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRMP19623 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRMP19623 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SRMP19623 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRMP19623 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SRMP19623 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRMP19623 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SRMP19623 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRMP19623 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRMP19623 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SRMP19623 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRMP19623 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRMP19623 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRMP19623 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SRMP19623 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRMP19623 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRMP19623 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRMP19623 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SRMP19623 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRMP19623 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRMP19623 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRMP19623 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRMP19623 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRMP19623 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SRMP19623 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRMP19623 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRMP19623 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRMP19623 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRMP19623 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRMP19623 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SRMP19623 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRMP19623 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRMP19623 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRMP19623 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRMP19623 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRMP19623 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRMP19623 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SRMP19623 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SRMP19623 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms