Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF7P17544 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF7P17544 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATF7P17544 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF7P17544 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF7P17544 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF7P17544 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATF7P17544 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF7P17544 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF7P17544 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF7P17544 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATF7P17544 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATF7P17544 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATF7P17544 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATF7P17544 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATF7P17544 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF7P17544 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF7P17544 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF7P17544 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF7P17544 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATF7P17544 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF7P17544 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF7P17544 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATF7P17544 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATF7P17544 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATF7P17544 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATF7P17544 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATF7P17544 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATF7P17544 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF7P17544 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF7P17544 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF7P17544 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATF7P17544 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF7P17544 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATF7P17544 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF7P17544 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF7P17544 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF7P17544 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF7P17544 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF7P17544 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATF7P17544 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATF7P17544 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATF7P17544 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATF7P17544 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATF7P17544 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATF7P17544 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATF7P17544 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF7P17544 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF7P17544 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF7P17544 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF7P17544 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATF7P17544 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATF7P17544 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATF7P17544 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF7P17544 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF7P17544 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF7P17544 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF7P17544 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF7P17544 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATF7P17544 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF7P17544 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF7P17544 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATF7P17544 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF7P17544 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF7P17544 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF7P17544 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATF7P17544 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF7P17544 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF7P17544 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF7P17544 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF7P17544 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF7P17544 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF7P17544 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ATF7P17544 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ATF7P17544 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATF7P17544 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATF7P17544 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATF7P17544 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATF7P17544 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATF7P17544 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ATF7P17544 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATF7P17544 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATF7P17544 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATF7P17544 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATF7P17544 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATF7P17544 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ATF7P17544 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATF7P17544 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATF7P17544 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATF7P17544 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATF7P17544 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATF7P17544 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATF7P17544 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATF7P17544 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATF7P17544 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATF7P17544 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATF7P17544 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATF7P17544 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATF7P17544 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ATF7P17544 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms