Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB9P17482 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB9P17482 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB9P17482 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB9P17482 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB9P17482 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB9P17482 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB9P17482 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB9P17482 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB9P17482 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB9P17482 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB9P17482 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB9P17482 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB9P17482 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB9P17482 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB9P17482 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB9P17482 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB9P17482 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB9P17482 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB9P17482 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB9P17482 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB9P17482 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB9P17482 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB9P17482 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXB9P17482 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB9P17482 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB9P17482 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB9P17482 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB9P17482 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB9P17482 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB9P17482 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB9P17482 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB9P17482 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB9P17482 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB9P17482 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB9P17482 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB9P17482 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB9P17482 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB9P17482 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB9P17482 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB9P17482 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB9P17482 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB9P17482 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB9P17482 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB9P17482 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB9P17482 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB9P17482 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB9P17482 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB9P17482 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB9P17482 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB9P17482 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB9P17482 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXB9P17482 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXB9P17482 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms