Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA2P17301 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGA2P17301 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ITGA2P17301 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA2P17301 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA2P17301 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA2P17301 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA2P17301 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGA2P17301 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA2P17301 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA2P17301 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA2P17301 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA2P17301 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA2P17301 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA2P17301 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA2P17301 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGA2P17301 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA2P17301 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA2P17301 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA2P17301 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA2P17301 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA2P17301 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGA2P17301 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA2P17301 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA2P17301 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ITGA2P17301 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA2P17301 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ITGA2P17301 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ITGA2P17301 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA2P17301 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA2P17301 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGA2P17301 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA2P17301 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA2P17301 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGA2P17301 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA2P17301 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA2P17301 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA2P17301 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA2P17301 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA2P17301 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA2P17301 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA2P17301 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA2P17301 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA2P17301 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA2P17301 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA2P17301 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA2P17301 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA2P17301 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA2P17301 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA2P17301 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA2P17301 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA2P17301 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA2P17301 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms