Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RARBP10826 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RARBP10826 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RARBP10826 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RARBP10826 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RARBP10826 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RARBP10826 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RARBP10826 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RARBP10826 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RARBP10826 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RARBP10826 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RARBP10826 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RARBP10826 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RARBP10826 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RARBP10826 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RARBP10826 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RARBP10826 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RARBP10826 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RARBP10826 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RARBP10826 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RARBP10826 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
RARBP10826 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RARBP10826 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RARBP10826 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RARBP10826 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RARBP10826 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RARBP10826 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RARBP10826 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RARBP10826 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RARBP10826 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RARBP10826 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RARBP10826 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RARBP10826 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RARBP10826 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RARBP10826 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RARBP10826 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
RARBP10826 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RARBP10826 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RARBP10826 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RARBP10826 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RARBP10826 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RARBP10826 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RARBP10826 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RARBP10826 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
RARBP10826 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RARBP10826 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RARBP10826 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RARBP10826 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RARBP10826 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RARBP10826 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RARBP10826 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RARBP10826 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RARBP10826 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RARBP10826 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RARBP10826 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RARBP10826 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RARBP10826 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RARBP10826 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RARBP10826 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RARBP10826 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RARBP10826 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RARBP10826 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RARBP10826 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RARBP10826 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RARBP10826 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RARBP10826 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RARBP10826 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RARBP10826 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RARBP10826 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RARBP10826 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RARBP10826 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RARBP10826 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RARBP10826 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RARBP10826 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RARBP10826 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RARBP10826 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RARBP10826 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RARBP10826 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RARBP10826 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RARBP10826 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RARBP10826 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RARBP10826 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RARBP10826 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RARBP10826 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RARBP10826 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RARBP10826 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RARBP10826 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
RARBP10826 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RARBP10826 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RARBP10826 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RARBP10826 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RARBP10826 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RARBP10826 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RARBP10826 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RARBP10826 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RARBP10826 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RARBP10826 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RARBP10826 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RARBP10826 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RARBP10826 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms