Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ86

DUX4L3, Double homeobox protein 4-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L3P0CJ86 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DUX4L3P0CJ86 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUX4L3P0CJ86 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DUX4L3P0CJ86 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUX4L3P0CJ86 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUX4L3P0CJ86 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUX4L3P0CJ86 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUX4L3P0CJ86 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DUX4L3P0CJ86 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUX4L3P0CJ86 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DUX4L3P0CJ86 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUX4L3P0CJ86 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUX4L3P0CJ86 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUX4L3P0CJ86 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUX4L3P0CJ86 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUX4L3P0CJ86 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUX4L3P0CJ86 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DUX4L3P0CJ86 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DUX4L3P0CJ86 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUX4L3P0CJ86 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUX4L3P0CJ86 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DUX4L3P0CJ86 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUX4L3P0CJ86 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUX4L3P0CJ86 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DUX4L3P0CJ86 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DUX4L3P0CJ86 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUX4L3P0CJ86 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUX4L3P0CJ86 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUX4L3P0CJ86 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DUX4L3P0CJ86 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DUX4L3P0CJ86 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUX4L3P0CJ86 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUX4L3P0CJ86 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUX4L3P0CJ86 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DUX4L3P0CJ86 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUX4L3P0CJ86 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUX4L3P0CJ86 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DUX4L3P0CJ86 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX4L3P0CJ86 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX4L3P0CJ86 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX4L3P0CJ86 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX4L3P0CJ86 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX4L3P0CJ86 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX4L3P0CJ86 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX4L3P0CJ86 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUX4L3P0CJ86 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUX4L3P0CJ86 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUX4L3P0CJ86 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUX4L3P0CJ86 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUX4L3P0CJ86 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUX4L3P0CJ86 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUX4L3P0CJ86 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DUX4L3P0CJ86 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUX4L3P0CJ86 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUX4L3P0CJ86 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUX4L3P0CJ86 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUX4L3P0CJ86 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DUX4L3P0CJ86 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUX4L3P0CJ86 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUX4L3P0CJ86 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DUX4L3P0CJ86 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms