Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LINC00271P0C7V0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LINC00271P0C7V0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LINC00271P0C7V0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LINC00271P0C7V0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LINC00271P0C7V0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LINC00271P0C7V0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LINC00271P0C7V0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LINC00271P0C7V0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LINC00271P0C7V0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LINC00271P0C7V0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LINC00271P0C7V0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LINC00271P0C7V0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LINC00271P0C7V0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LINC00271P0C7V0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LINC00271P0C7V0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LINC00271P0C7V0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LINC00271P0C7V0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LINC00271P0C7V0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LINC00271P0C7V0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LINC00271P0C7V0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LINC00271P0C7V0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LINC00271P0C7V0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LINC00271P0C7V0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LINC00271P0C7V0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LINC00271P0C7V0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LINC00271P0C7V0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LINC00271P0C7V0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LINC00271P0C7V0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LINC00271P0C7V0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LINC00271P0C7V0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LINC00271P0C7V0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LINC00271P0C7V0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LINC00271P0C7V0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LINC00271P0C7V0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LINC00271P0C7V0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LINC00271P0C7V0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms