Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSLP07711 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSLP07711 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSLP07711 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSLP07711 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSLP07711 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSLP07711 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSLP07711 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSLP07711 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSLP07711 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSLP07711 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSLP07711 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSLP07711 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSLP07711 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSLP07711 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTSLP07711 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CTSLP07711 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTSLP07711 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTSLP07711 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTSLP07711 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTSLP07711 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTSLP07711 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTSLP07711 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTSLP07711 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTSLP07711 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTSLP07711 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTSLP07711 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTSLP07711 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CTSLP07711 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTSLP07711 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTSLP07711 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTSLP07711 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTSLP07711 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTSLP07711 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTSLP07711 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTSLP07711 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTSLP07711 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTSLP07711 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTSLP07711 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTSLP07711 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTSLP07711 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTSLP07711 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTSLP07711 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTSLP07711 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTSLP07711 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTSLP07711 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTSLP07711 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CTSLP07711 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTSLP07711 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTSLP07711 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSLP07711 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSLP07711 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSLP07711 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTSLP07711 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTSLP07711 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTSLP07711 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTSLP07711 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTSLP07711 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSLP07711 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSLP07711 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSLP07711 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSLP07711 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSLP07711 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSLP07711 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSLP07711 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSLP07711 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSLP07711 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSLP07711 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSLP07711 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTSLP07711 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTSLP07711 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTSLP07711 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTSLP07711 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CTSLP07711 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTSLP07711 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTSLP07711 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTSLP07711 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTSLP07711 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTSLP07711 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CTSLP07711 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTSLP07711 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTSLP07711 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTSLP07711 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTSLP07711 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTSLP07711 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTSLP07711 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTSLP07711 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTSLP07711 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTSLP07711 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTSLP07711 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTSLP07711 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTSLP07711 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTSLP07711 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTSLP07711 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTSLP07711 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTSLP07711 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTSLP07711 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTSLP07711 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTSLP07711 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CTSLP07711 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.4 ms