Protein–RNA interactions for Protein: P04156

PRNP, Major prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNPP04156 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRNPP04156 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRNPP04156 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRNPP04156 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRNPP04156 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PRNPP04156 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRNPP04156 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRNPP04156 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRNPP04156 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRNPP04156 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRNPP04156 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRNPP04156 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRNPP04156 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRNPP04156 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRNPP04156 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRNPP04156 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRNPP04156 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRNPP04156 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRNPP04156 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRNPP04156 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRNPP04156 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRNPP04156 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRNPP04156 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRNPP04156 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRNPP04156 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRNPP04156 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PRNPP04156 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRNPP04156 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRNPP04156 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRNPP04156 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PRNPP04156 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRNPP04156 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRNPP04156 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRNPP04156 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRNPP04156 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRNPP04156 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRNPP04156 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRNPP04156 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRNPP04156 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRNPP04156 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRNPP04156 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRNPP04156 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRNPP04156 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRNPP04156 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRNPP04156 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRNPP04156 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRNPP04156 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRNPP04156 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRNPP04156 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRNPP04156 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRNPP04156 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRNPP04156 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRNPP04156 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRNPP04156 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRNPP04156 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRNPP04156 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRNPP04156 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRNPP04156 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRNPP04156 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PRNPP04156 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRNPP04156 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRNPP04156 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRNPP04156 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRNPP04156 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRNPP04156 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRNPP04156 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRNPP04156 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRNPP04156 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRNPP04156 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRNPP04156 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRNPP04156 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRNPP04156 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRNPP04156 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRNPP04156 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRNPP04156 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRNPP04156 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRNPP04156 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRNPP04156 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRNPP04156 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRNPP04156 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRNPP04156 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRNPP04156 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRNPP04156 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRNPP04156 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRNPP04156 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRNPP04156 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PRNPP04156 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRNPP04156 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRNPP04156 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRNPP04156 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRNPP04156 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRNPP04156 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRNPP04156 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRNPP04156 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRNPP04156 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRNPP04156 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRNPP04156 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRNPP04156 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRNPP04156 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRNPP04156 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 222.4 ms