Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EGFRP00533 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EGFRP00533 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
EGFRP00533 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
EGFRP00533 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
EGFRP00533 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
EGFRP00533 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
EGFRP00533 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EGFRP00533 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EGFRP00533 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
EGFRP00533 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
EGFRP00533 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
EGFRP00533 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EGFRP00533 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
EGFRP00533 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
EGFRP00533 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
EGFRP00533 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
EGFRP00533 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.2■■■□□ 2.43
EGFRP00533 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
EGFRP00533 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
EGFRP00533 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EGFRP00533 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
EGFRP00533 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
EGFRP00533 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
EGFRP00533 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
EGFRP00533 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
EGFRP00533 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EGFRP00533 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
EGFRP00533 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
EGFRP00533 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EGFRP00533 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EGFRP00533 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
EGFRP00533 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
EGFRP00533 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
EGFRP00533 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
EGFRP00533 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
EGFRP00533 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
EGFRP00533 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
EGFRP00533 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
EGFRP00533 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
EGFRP00533 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
EGFRP00533 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
EGFRP00533 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
EGFRP00533 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
EGFRP00533 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
EGFRP00533 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EGFRP00533 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EGFRP00533 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EGFRP00533 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
EGFRP00533 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
EGFRP00533 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
EGFRP00533 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
EGFRP00533 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EGFRP00533 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
EGFRP00533 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EGFRP00533 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EGFRP00533 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EGFRP00533 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EGFRP00533 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EGFRP00533 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
EGFRP00533 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
EGFRP00533 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EGFRP00533 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EGFRP00533 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
EGFRP00533 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
EGFRP00533 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
EGFRP00533 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
EGFRP00533 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
EGFRP00533 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
EGFRP00533 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
EGFRP00533 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EGFRP00533 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EGFRP00533 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
EGFRP00533 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EGFRP00533 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
EGFRP00533 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EGFRP00533 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
EGFRP00533 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
EGFRP00533 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EGFRP00533 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
EGFRP00533 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
EGFRP00533 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EGFRP00533 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EGFRP00533 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EGFRP00533 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EGFRP00533 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
EGFRP00533 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EGFRP00533 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
EGFRP00533 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
EGFRP00533 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
EGFRP00533 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EGFRP00533 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
EGFRP00533 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
EGFRP00533 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EGFRP00533 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
EGFRP00533 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
EGFRP00533 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EGFRP00533 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
EGFRP00533 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
EGFRP00533 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms