Protein–RNA interactions for Protein: O95721

SNAP29, Synaptosomal-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP29O95721 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNAP29O95721 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNAP29O95721 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNAP29O95721 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP29O95721 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNAP29O95721 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP29O95721 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP29O95721 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP29O95721 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNAP29O95721 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP29O95721 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP29O95721 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNAP29O95721 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP29O95721 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP29O95721 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP29O95721 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP29O95721 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP29O95721 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP29O95721 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP29O95721 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP29O95721 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNAP29O95721 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP29O95721 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP29O95721 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP29O95721 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNAP29O95721 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP29O95721 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNAP29O95721 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNAP29O95721 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.9 ms