Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SNAPINO95295 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNAPINO95295 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNAPINO95295 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNAPINO95295 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms