Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
UBE4BO95155 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE4BO95155 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE4BO95155 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE4BO95155 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE4BO95155 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
UBE4BO95155 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE4BO95155 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
UBE4BO95155 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE4BO95155 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE4BO95155 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE4BO95155 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE4BO95155 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE4BO95155 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE4BO95155 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE4BO95155 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE4BO95155 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE4BO95155 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
UBE4BO95155 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE4BO95155 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE4BO95155 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
UBE4BO95155 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE4BO95155 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
UBE4BO95155 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE4BO95155 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE4BO95155 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE4BO95155 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE4BO95155 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE4BO95155 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE4BO95155 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE4BO95155 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE4BO95155 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE4BO95155 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE4BO95155 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE4BO95155 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE4BO95155 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE4BO95155 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms