Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRIOO75962 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TRIOO75962 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIOO75962 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIOO75962 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIOO75962 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIOO75962 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIOO75962 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRIOO75962 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIOO75962 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIOO75962 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRIOO75962 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIOO75962 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIOO75962 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRIOO75962 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIOO75962 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIOO75962 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIOO75962 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIOO75962 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TRIOO75962 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TRIOO75962 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIOO75962 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIOO75962 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TRIOO75962 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIOO75962 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIOO75962 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIOO75962 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIOO75962 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIOO75962 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIOO75962 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIOO75962 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIOO75962 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIOO75962 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIOO75962 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIOO75962 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIOO75962 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIOO75962 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIOO75962 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIOO75962 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIOO75962 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIOO75962 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIOO75962 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIOO75962 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIOO75962 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIOO75962 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIOO75962 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIOO75962 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIOO75962 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIOO75962 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIOO75962 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIOO75962 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIOO75962 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIOO75962 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TRIOO75962 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIOO75962 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIOO75962 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIOO75962 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIOO75962 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIOO75962 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIOO75962 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIOO75962 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIOO75962 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIOO75962 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIOO75962 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIOO75962 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIOO75962 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIOO75962 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIOO75962 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIOO75962 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIOO75962 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIOO75962 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIOO75962 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIOO75962 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIOO75962 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIOO75962 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIOO75962 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIOO75962 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIOO75962 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIOO75962 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIOO75962 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIOO75962 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIOO75962 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIOO75962 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIOO75962 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIOO75962 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIOO75962 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIOO75962 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRIOO75962 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIOO75962 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIOO75962 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIOO75962 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIOO75962 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRIOO75962 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIOO75962 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIOO75962 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIOO75962 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIOO75962 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIOO75962 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIOO75962 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIOO75962 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms