Protein–RNA interactions for Protein: O75110

ATP9A, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9AO75110 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP9AO75110 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP9AO75110 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP9AO75110 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP9AO75110 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP9AO75110 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP9AO75110 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP9AO75110 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP9AO75110 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP9AO75110 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP9AO75110 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP9AO75110 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP9AO75110 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP9AO75110 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP9AO75110 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP9AO75110 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP9AO75110 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP9AO75110 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP9AO75110 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP9AO75110 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP9AO75110 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP9AO75110 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP9AO75110 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ATP9AO75110 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP9AO75110 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP9AO75110 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP9AO75110 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP9AO75110 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP9AO75110 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP9AO75110 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP9AO75110 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP9AO75110 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP9AO75110 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP9AO75110 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP9AO75110 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP9AO75110 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP9AO75110 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP9AO75110 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP9AO75110 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP9AO75110 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP9AO75110 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP9AO75110 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP9AO75110 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP9AO75110 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP9AO75110 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP9AO75110 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP9AO75110 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP9AO75110 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP9AO75110 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP9AO75110 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP9AO75110 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP9AO75110 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP9AO75110 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP9AO75110 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP9AO75110 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP9AO75110 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP9AO75110 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP9AO75110 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP9AO75110 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP9AO75110 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP9AO75110 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATP9AO75110 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP9AO75110 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATP9AO75110 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ATP9AO75110 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ATP9AO75110 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ATP9AO75110 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms