Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC22O60826 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC22O60826 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC22O60826 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC22O60826 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC22O60826 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC22O60826 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC22O60826 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC22O60826 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC22O60826 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC22O60826 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC22O60826 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC22O60826 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC22O60826 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC22O60826 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC22O60826 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC22O60826 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC22O60826 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC22O60826 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC22O60826 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC22O60826 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC22O60826 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC22O60826 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC22O60826 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC22O60826 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC22O60826 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC22O60826 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC22O60826 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC22O60826 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC22O60826 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC22O60826 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC22O60826 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC22O60826 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC22O60826 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms