Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNCRIPO60506 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNCRIPO60506 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYNCRIPO60506 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNCRIPO60506 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNCRIPO60506 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYNCRIPO60506 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNCRIPO60506 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYNCRIPO60506 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNCRIPO60506 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNCRIPO60506 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYNCRIPO60506 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNCRIPO60506 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNCRIPO60506 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNCRIPO60506 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNCRIPO60506 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNCRIPO60506 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNCRIPO60506 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNCRIPO60506 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYNCRIPO60506 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNCRIPO60506 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNCRIPO60506 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNCRIPO60506 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNCRIPO60506 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYNCRIPO60506 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNCRIPO60506 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNCRIPO60506 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNCRIPO60506 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SYNCRIPO60506 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SYNCRIPO60506 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNCRIPO60506 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms