Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC25A20O43772 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC25A20O43772 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SLC25A20O43772 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A20O43772 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A20O43772 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A20O43772 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A20O43772 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A20O43772 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A20O43772 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A20O43772 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SLC25A20O43772 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A20O43772 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A20O43772 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A20O43772 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A20O43772 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A20O43772 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A20O43772 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A20O43772 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A20O43772 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A20O43772 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A20O43772 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SLC25A20O43772 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SLC25A20O43772 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SLC25A20O43772 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms