Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
HTATSF1O43719 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
HTATSF1O43719 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
HTATSF1O43719 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
HTATSF1O43719 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
HTATSF1O43719 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
HTATSF1O43719 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
HTATSF1O43719 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
HTATSF1O43719 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
HTATSF1O43719 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
HTATSF1O43719 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
HTATSF1O43719 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
HTATSF1O43719 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
HTATSF1O43719 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
HTATSF1O43719 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
HTATSF1O43719 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
HTATSF1O43719 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
HTATSF1O43719 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
HTATSF1O43719 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
HTATSF1O43719 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
HTATSF1O43719 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
HTATSF1O43719 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
HTATSF1O43719 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
HTATSF1O43719 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
HTATSF1O43719 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
HTATSF1O43719 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
HTATSF1O43719 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
HTATSF1O43719 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
HTATSF1O43719 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HTATSF1O43719 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
HTATSF1O43719 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
HTATSF1O43719 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
HTATSF1O43719 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
HTATSF1O43719 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
HTATSF1O43719 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
HTATSF1O43719 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
HTATSF1O43719 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
HTATSF1O43719 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
HTATSF1O43719 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
HTATSF1O43719 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
HTATSF1O43719 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
HTATSF1O43719 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
HTATSF1O43719 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
HTATSF1O43719 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
HTATSF1O43719 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
HTATSF1O43719 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
HTATSF1O43719 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
HTATSF1O43719 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
HTATSF1O43719 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
HTATSF1O43719 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
HTATSF1O43719 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
HTATSF1O43719 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
HTATSF1O43719 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
HTATSF1O43719 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
HTATSF1O43719 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
HTATSF1O43719 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
HTATSF1O43719 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
HTATSF1O43719 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
HTATSF1O43719 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
HTATSF1O43719 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
HTATSF1O43719 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
HTATSF1O43719 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
HTATSF1O43719 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
HTATSF1O43719 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
HTATSF1O43719 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
HTATSF1O43719 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
HTATSF1O43719 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
HTATSF1O43719 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
HTATSF1O43719 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
HTATSF1O43719 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
HTATSF1O43719 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
HTATSF1O43719 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
HTATSF1O43719 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
HTATSF1O43719 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
HTATSF1O43719 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
HTATSF1O43719 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
HTATSF1O43719 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
HTATSF1O43719 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
HTATSF1O43719 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
HTATSF1O43719 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.52■■■□□ 2.8
HTATSF1O43719 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
HTATSF1O43719 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
HTATSF1O43719 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
HTATSF1O43719 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
HTATSF1O43719 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
HTATSF1O43719 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
HTATSF1O43719 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
HTATSF1O43719 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
HTATSF1O43719 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
HTATSF1O43719 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
HTATSF1O43719 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
HTATSF1O43719 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
HTATSF1O43719 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
HTATSF1O43719 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
HTATSF1O43719 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
HTATSF1O43719 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
HTATSF1O43719 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
HTATSF1O43719 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
HTATSF1O43719 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
HTATSF1O43719 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms