Protein–RNA interactions for Protein: O43323

DHH, Desert hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHHO43323 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHHO43323 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHHO43323 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHHO43323 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHHO43323 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHHO43323 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHHO43323 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DHHO43323 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DHHO43323 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHHO43323 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHHO43323 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DHHO43323 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHHO43323 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHHO43323 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHHO43323 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHHO43323 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHHO43323 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DHHO43323 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHHO43323 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHHO43323 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHHO43323 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHHO43323 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHHO43323 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHHO43323 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DHHO43323 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DHHO43323 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHHO43323 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHHO43323 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHHO43323 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHHO43323 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHHO43323 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DHHO43323 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DHHO43323 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DHHO43323 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DHHO43323 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DHHO43323 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DHHO43323 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DHHO43323 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DHHO43323 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DHHO43323 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DHHO43323 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DHHO43323 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DHHO43323 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DHHO43323 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DHHO43323 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DHHO43323 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DHHO43323 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DHHO43323 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DHHO43323 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DHHO43323 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DHHO43323 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DHHO43323 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DHHO43323 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DHHO43323 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DHHO43323 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DHHO43323 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHHO43323 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DHHO43323 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHHO43323 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHHO43323 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHHO43323 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHHO43323 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHHO43323 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHHO43323 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DHHO43323 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHHO43323 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHHO43323 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHHO43323 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHHO43323 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DHHO43323 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DHHO43323 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DHHO43323 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DHHO43323 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHHO43323 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHHO43323 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHHO43323 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DHHO43323 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHHO43323 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHHO43323 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHHO43323 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHHO43323 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
DHHO43323 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHHO43323 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHHO43323 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHHO43323 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHHO43323 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHHO43323 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DHHO43323 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DHHO43323 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DHHO43323 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DHHO43323 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DHHO43323 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DHHO43323 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
DHHO43323 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DHHO43323 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DHHO43323 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DHHO43323 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DHHO43323 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DHHO43323 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DHHO43323 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms