Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCP110O43303 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCP110O43303 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCP110O43303 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCP110O43303 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCP110O43303 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCP110O43303 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCP110O43303 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCP110O43303 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCP110O43303 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCP110O43303 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCP110O43303 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCP110O43303 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCP110O43303 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCP110O43303 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCP110O43303 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCP110O43303 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCP110O43303 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCP110O43303 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCP110O43303 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCP110O43303 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCP110O43303 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCP110O43303 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCP110O43303 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCP110O43303 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCP110O43303 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCP110O43303 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCP110O43303 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCP110O43303 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCP110O43303 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCP110O43303 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCP110O43303 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCP110O43303 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCP110O43303 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCP110O43303 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCP110O43303 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCP110O43303 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCP110O43303 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCP110O43303 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCP110O43303 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCP110O43303 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCP110O43303 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CCP110O43303 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCP110O43303 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CCP110O43303 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCP110O43303 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCP110O43303 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CCP110O43303 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCP110O43303 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCP110O43303 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CCP110O43303 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCP110O43303 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCP110O43303 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCP110O43303 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CCP110O43303 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCP110O43303 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCP110O43303 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCP110O43303 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCP110O43303 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCP110O43303 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCP110O43303 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CCP110O43303 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCP110O43303 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCP110O43303 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCP110O43303 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCP110O43303 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCP110O43303 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCP110O43303 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCP110O43303 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCP110O43303 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCP110O43303 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCP110O43303 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CCP110O43303 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCP110O43303 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCP110O43303 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCP110O43303 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCP110O43303 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCP110O43303 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCP110O43303 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCP110O43303 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCP110O43303 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCP110O43303 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCP110O43303 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCP110O43303 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCP110O43303 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCP110O43303 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCP110O43303 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCP110O43303 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCP110O43303 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCP110O43303 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCP110O43303 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCP110O43303 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCP110O43303 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCP110O43303 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCP110O43303 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCP110O43303 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCP110O43303 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCP110O43303 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCP110O43303 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCP110O43303 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms