Protein–RNA interactions for Protein: O15245

SLC22A1, Solute carrier family 22 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A1O15245 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC22A1O15245 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC22A1O15245 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A1O15245 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A1O15245 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC22A1O15245 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A1O15245 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A1O15245 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A1O15245 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A1O15245 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A1O15245 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A1O15245 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC22A1O15245 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A1O15245 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A1O15245 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC22A1O15245 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A1O15245 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A1O15245 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC22A1O15245 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A1O15245 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A1O15245 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A1O15245 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A1O15245 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A1O15245 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC22A1O15245 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC22A1O15245 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC22A1O15245 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC22A1O15245 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC22A1O15245 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC22A1O15245 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms