Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
N4BP3O15049 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
N4BP3O15049 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
N4BP3O15049 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
N4BP3O15049 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
N4BP3O15049 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
N4BP3O15049 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
N4BP3O15049 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
N4BP3O15049 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
N4BP3O15049 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
N4BP3O15049 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
N4BP3O15049 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
N4BP3O15049 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
N4BP3O15049 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
N4BP3O15049 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
N4BP3O15049 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
N4BP3O15049 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
N4BP3O15049 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
N4BP3O15049 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
N4BP3O15049 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
N4BP3O15049 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
N4BP3O15049 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
N4BP3O15049 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
N4BP3O15049 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
N4BP3O15049 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
N4BP3O15049 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
N4BP3O15049 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
N4BP3O15049 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
N4BP3O15049 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
N4BP3O15049 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
N4BP3O15049 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
N4BP3O15049 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
N4BP3O15049 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
N4BP3O15049 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
N4BP3O15049 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
N4BP3O15049 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
N4BP3O15049 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
N4BP3O15049 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
N4BP3O15049 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
N4BP3O15049 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
N4BP3O15049 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
N4BP3O15049 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
N4BP3O15049 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
N4BP3O15049 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
N4BP3O15049 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
N4BP3O15049 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
N4BP3O15049 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
N4BP3O15049 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
N4BP3O15049 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
N4BP3O15049 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
N4BP3O15049 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
N4BP3O15049 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
N4BP3O15049 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
N4BP3O15049 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
N4BP3O15049 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
N4BP3O15049 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
N4BP3O15049 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
N4BP3O15049 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
N4BP3O15049 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
N4BP3O15049 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
N4BP3O15049 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
N4BP3O15049 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
N4BP3O15049 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
N4BP3O15049 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
N4BP3O15049 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
N4BP3O15049 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
N4BP3O15049 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
N4BP3O15049 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.2 ms