Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H7C0C1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
H7C0C1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H7C0C1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C0C1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C0C1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C0C1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C0C1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C0C1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C0C1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C0C1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
H7C0C1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H7C0C1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H7C0C1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H7C0C1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
H7C0C1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H7C0C1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
H7C0C1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H7C0C1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H7C0C1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
H7C0C1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
H7C0C1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
H7C0C1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
H7C0C1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
H7C0C1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C0C1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C0C1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C0C1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
H7C0C1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C0C1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C0C1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C0C1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
H7C0C1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C0C1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C0C1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C0C1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
H7C0C1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C0C1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C0C1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C0C1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C0C1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C0C1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
H7C0C1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C0C1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C0C1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C0C1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C0C1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C0C1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C0C1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C0C1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C0C1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C0C1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C0C1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C0C1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C0C1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
H7C0C1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H7C0C1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H7C0C1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H7C0C1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
H7C0C1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
H7C0C1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
H7C0C1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C0C1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C0C1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C0C1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C0C1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C0C1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C0C1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C0C1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C0C1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C0C1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C0C1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
H7C0C1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
H7C0C1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
H7C0C1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
H7C0C1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
H7C0C1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
H7C0C1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
H7C0C1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
H7C0C1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
H7C0C1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
H7C0C1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
H7C0C1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H7C0C1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
H7C0C1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
H7C0C1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
H7C0C1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H7C0C1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
H7C0C1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
H7C0C1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H7C0C1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H7C0C1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
H7C0C1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
H7C0C1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H7C0C1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H7C0C1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
H7C0C1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
H7C0C1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
H7C0C1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
H7C0C1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms