Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
BHMG1C9JSJ3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
BHMG1C9JSJ3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
BHMG1C9JSJ3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BHMG1C9JSJ3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BHMG1C9JSJ3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BHMG1C9JSJ3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BHMG1C9JSJ3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BHMG1C9JSJ3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
BHMG1C9JSJ3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BHMG1C9JSJ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BHMG1C9JSJ3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BHMG1C9JSJ3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BHMG1C9JSJ3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BHMG1C9JSJ3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BHMG1C9JSJ3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BHMG1C9JSJ3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BHMG1C9JSJ3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BHMG1C9JSJ3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BHMG1C9JSJ3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BHMG1C9JSJ3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BHMG1C9JSJ3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BHMG1C9JSJ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BHMG1C9JSJ3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BHMG1C9JSJ3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BHMG1C9JSJ3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BHMG1C9JSJ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
BHMG1C9JSJ3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BHMG1C9JSJ3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BHMG1C9JSJ3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BHMG1C9JSJ3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BHMG1C9JSJ3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BHMG1C9JSJ3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BHMG1C9JSJ3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BHMG1C9JSJ3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BHMG1C9JSJ3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BHMG1C9JSJ3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BHMG1C9JSJ3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BHMG1C9JSJ3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BHMG1C9JSJ3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BHMG1C9JSJ3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BHMG1C9JSJ3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BHMG1C9JSJ3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BHMG1C9JSJ3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BHMG1C9JSJ3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BHMG1C9JSJ3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BHMG1C9JSJ3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BHMG1C9JSJ3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BHMG1C9JSJ3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BHMG1C9JSJ3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BHMG1C9JSJ3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BHMG1C9JSJ3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BHMG1C9JSJ3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BHMG1C9JSJ3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BHMG1C9JSJ3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BHMG1C9JSJ3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BHMG1C9JSJ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BHMG1C9JSJ3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms