Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CLDN25C9JDP6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN25C9JDP6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLDN25C9JDP6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN25C9JDP6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms