Protein–RNA interactions for Protein: A8MX34

KRTAP29-1, Keratin-associated protein 29-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP29-1A8MX34 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRTAP29-1A8MX34 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms