Protein–RNA interactions for Protein: A6NHL2

TUBAL3, Tubulin alpha chain-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBAL3A6NHL2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBAL3A6NHL2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBAL3A6NHL2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBAL3A6NHL2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBAL3A6NHL2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms