Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ZNF316A6NFI3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ZNF316A6NFI3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ZNF316A6NFI3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ZNF316A6NFI3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ZNF316A6NFI3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
ZNF316A6NFI3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ZNF316A6NFI3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
ZNF316A6NFI3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ZNF316A6NFI3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ZNF316A6NFI3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
ZNF316A6NFI3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
ZNF316A6NFI3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
ZNF316A6NFI3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ZNF316A6NFI3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
ZNF316A6NFI3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ZNF316A6NFI3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ZNF316A6NFI3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ZNF316A6NFI3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ZNF316A6NFI3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
ZNF316A6NFI3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
ZNF316A6NFI3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
ZNF316A6NFI3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ZNF316A6NFI3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ZNF316A6NFI3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ZNF316A6NFI3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ZNF316A6NFI3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ZNF316A6NFI3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ZNF316A6NFI3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ZNF316A6NFI3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ZNF316A6NFI3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ZNF316A6NFI3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ZNF316A6NFI3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ZNF316A6NFI3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ZNF316A6NFI3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
ZNF316A6NFI3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ZNF316A6NFI3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ZNF316A6NFI3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ZNF316A6NFI3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ZNF316A6NFI3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
ZNF316A6NFI3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
ZNF316A6NFI3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ZNF316A6NFI3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ZNF316A6NFI3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ZNF316A6NFI3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ZNF316A6NFI3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ZNF316A6NFI3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ZNF316A6NFI3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ZNF316A6NFI3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ZNF316A6NFI3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ZNF316A6NFI3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ZNF316A6NFI3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ZNF316A6NFI3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ZNF316A6NFI3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ZNF316A6NFI3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ZNF316A6NFI3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ZNF316A6NFI3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ZNF316A6NFI3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ZNF316A6NFI3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ZNF316A6NFI3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ZNF316A6NFI3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ZNF316A6NFI3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ZNF316A6NFI3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ZNF316A6NFI3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ZNF316A6NFI3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ZNF316A6NFI3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ZNF316A6NFI3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ZNF316A6NFI3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ZNF316A6NFI3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ZNF316A6NFI3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ZNF316A6NFI3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
ZNF316A6NFI3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ZNF316A6NFI3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ZNF316A6NFI3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ZNF316A6NFI3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
ZNF316A6NFI3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ZNF316A6NFI3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
ZNF316A6NFI3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
ZNF316A6NFI3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
ZNF316A6NFI3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ZNF316A6NFI3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
ZNF316A6NFI3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
ZNF316A6NFI3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
ZNF316A6NFI3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
ZNF316A6NFI3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
ZNF316A6NFI3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
ZNF316A6NFI3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
ZNF316A6NFI3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
ZNF316A6NFI3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
ZNF316A6NFI3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
ZNF316A6NFI3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
ZNF316A6NFI3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ZNF316A6NFI3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ZNF316A6NFI3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ZNF316A6NFI3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ZNF316A6NFI3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ZNF316A6NFI3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ZNF316A6NFI3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ZNF316A6NFI3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ZNF316A6NFI3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms