Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA6CA6NDK9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA6CA6NDK9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA6CA6NDK9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA6CA6NDK9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA6CA6NDK9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA6CA6NDK9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GOLGA6CA6NDK9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GOLGA6CA6NDK9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA6CA6NDK9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA6CA6NDK9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GOLGA6CA6NDK9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6CA6NDK9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GOLGA6CA6NDK9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GOLGA6CA6NDK9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GOLGA6CA6NDK9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GOLGA6CA6NDK9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOLGA6CA6NDK9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOLGA6CA6NDK9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GOLGA6CA6NDK9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GOLGA6CA6NDK9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms