Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL33A6NCF5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL33A6NCF5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL33A6NCF5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL33A6NCF5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL33A6NCF5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL33A6NCF5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL33A6NCF5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL33A6NCF5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KLHL33A6NCF5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL33A6NCF5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL33A6NCF5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms