Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP69A5D8W1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CFAP69A5D8W1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP69A5D8W1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP69A5D8W1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP69A5D8W1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP69A5D8W1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP69A5D8W1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP69A5D8W1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP69A5D8W1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP69A5D8W1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP69A5D8W1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP69A5D8W1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP69A5D8W1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP69A5D8W1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP69A5D8W1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP69A5D8W1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP69A5D8W1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP69A5D8W1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP69A5D8W1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP69A5D8W1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP69A5D8W1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP69A5D8W1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP69A5D8W1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP69A5D8W1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP69A5D8W1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CFAP69A5D8W1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms