Protein–RNA interactions for Protein: A1X283

SH3PXD2B, SH3 and PX domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3PXD2BA1X283 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3PXD2BA1X283 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3PXD2BA1X283 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3PXD2BA1X283 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3PXD2BA1X283 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3PXD2BA1X283 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3PXD2BA1X283 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3PXD2BA1X283 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3PXD2BA1X283 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3PXD2BA1X283 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3PXD2BA1X283 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SH3PXD2BA1X283 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 230.5 ms